Головною метою інституту є об’єднання професіоналів зацікавлених у якості і безпечності харчових продуктів, води, пест контролю (контролю шкідників), продовольчої логістики, фітосанітарії, сертифікації та стандартизації харчових продуктів, пестицидів та агрохімікатів задля спільної розробки та впровадження дієвих проектів, спрямованих на дослідження, навчання, розробку, популяризацію норм та правил екологічного та безпечного виробництва, реалізації та споживання продукції, а також на наближення життя громадян України до найкращих світових стандартів.